一、配置Git

1-1：初始化配置

首先进入终端，配置用户名

git config --global user.name "LxlTx" 

然后配置邮箱

git config --global user.email 1176949705@qq.com 

保存用户名和密码到本地

git config --global credential.helper store 

列出当前用户的全局 Git 配置信息

git config --global --list 

1-2：克隆仓库

首先新建一个目录

mkdir learn 

进入新建的目录

cd learn 

克隆仓库

git clone https://github.com/mahmoodlab/HIPT.git 

查看一下仓库中的文件目录

ls -ltr 

现在进入仓库

cd HIPT 

再去检查仓库是否导入

二、配置环境

2-1：创建虚拟环境

创建一个虚拟环境，可以自定义名字，并且指定python版本

conda create -n HIPT python=3.10 

然后进入自己刚刚创建的虚拟环境

conda activate HIPT 

2-2：安装依赖环境

先安装requirements中的包

pip install -r requirements.txt 

三、服务器端的Jupyter

这里先介绍如何使用Jupyter连接服务器，下一节会介绍如何使用Pycharm连接服务器。二者的适用场景不同，前者适合轻量级的项目，后者适合多进程项目，通过后续的学习你们就会清楚了，这里先不展开介绍。

对于本节不清楚的，可以移步参考教程。

3-1：初始化配置

安装jupyter

conda install jupyter 

启动jupyter

jupyter notebook --no-browser 

后面的–no-browser是指无浏览器模式，因为我们想用本地的浏览器来打开jupyter。执行命令以后，会看到一对指令，找到下图对应的位置，记住你的端口号。

这个端口号是用来与本地建立端口转发的。通过端口转发，就可以在本地浏览器上打开服务器上的文件夹进行相应的操作。

3-2：终端配置

打开终端

输入如下代码之后，会让你输入密码，即为服务器账户密码。

ssh -N -L localhost:8888:localhost:8888 user_name@ip 

注意，这个密码的输入过程是不显示在屏幕上的，不要以为是你的电脑坏了，如果密码错误会让你重新输入，密码正确则什么也不会显示。其中的8888即3-1中提到的端口号，后面的user_name@ip即为你服务器的账户和ip地址。

浏览器配置

在上一步正确输入密码之后，打开你的浏览器，在网址栏输入如下localhost:8888后，会进入如下界面。

不知道怎么获取Token的，看这张图。

成功界面如下。

现在让我们新建一个文档来玩玩吧。

随便写一行代码试试。

这里要提一嘴，Jupyter跑R语言也是可行的。

简单做个示范。

未完待续

小罗饿了，要去吃饭了，下午回来继续更新，回见！！