用户在进行扫码支付时是否从卡里扣款，主要取决于用户的支付设置以及支付时的自由选择，现代支付工具如微信和支付宝提供了灵活的支付方式选择，包括零钱、借记卡和信用卡等，让用户可以根据自己的资金情况和偏好进行选择。

扫码支付是一种便捷的移动支付方式，它允许用户通过扫描二维码来执行支付操作，通常用于线上购物、线下店铺消费和P2P转账等场景，在扫码支付中，用户可以选择多种资金来源进行支付，包括微信或支付宝的零钱、借记卡、信用卡等，选择不同的资金来源会直接影响到扣款的账户，如果用户选择使用银行卡（无论是借记卡还是信用卡），则款项会从相应的银行卡中扣除。

根据支付工具的不同，用户在支付时可以选择不同的支付方式，在微信支付中，用户可以在出示付款码页面下方自由选择从微信零钱或是绑定的银行卡支付，同样地，在支付宝支付中，用户也可以在支付前选择零钱、蚂蚁花呗、信用卡或借记卡等作为支付来源，如果在扫码支付时选择了银行卡作为支付来源，那么资金就会从所选的银行卡中扣除。

用户在进行扫码支付时可能未意识到自己选择的是银行卡支付，或者因为零钱余额不足，系统自动切换到银行卡支付，支付平台可能具有设定优先支付方式的功能，如果用户未主动更改设置，系统会按照设定的优先级选择资金来源，若用户将银行卡设置为优先支付方式，则在操作扫码支付时，即使未主动选择，也可能会从银行卡扣款。

有些商家可能未开通某些支付方式，如信用卡收款，这也会影响支付方式的选择，在这种情况下，即便用户希望使用信用卡支付，也会因为商家的收款限制而自动切换到另一种支付方式，通常是借记卡或零钱支付。

为了确保用户能够更好地管理自己的支付方式，避免不必要的费用或透支，建议在做扫码支付前确认自己的支付方式选择，并适时查看并调整支付设置中的优先支付顺序，在支付宝和微信中，用户都可以在支付设置中找到扣款顺序的调整选项，通过简单操作即可调整支付来源的顺序，这样，在下次支付时，系统会按照用户设定的新顺序来选择资金来源。

扫码支付时选择从银行卡扣款主要是因为用户在支付方式的选择上偏向于使用银行卡，或是因为相关支付平台的默认设置，正确管理和选择支付方式对于个人资金安全和便捷支付体验至关重要。